三阴交是三条阴经肝、脾、肾在下肢交会的一个部位，因此对三阴交的治疗可以调理肝脾肾三经。

艾灸三阴交有助阳以及温通经络的作用，对于许多系统的疾病都有很好的治疗作用，比如对于泌尿系统，像小便不利、水肿等等都有一定的治疗作用。还有对于生殖系统，像妇科的月经不调、宫冷宫寒不孕，以及男科的阳痿早泄、性机能的减退等等，都有一定的治疗作用。另外由于它是脾经的一个交会穴，因此对于人体气血不足，消化不良也有一定的治疗作用。