肥胖中原因未明的单纯性肥胖，它的主要原因是摄入的能量大于消耗的能量，它也有一定的遗传因素。一般我们认为人类的种族易患性，还有肥胖的基因，以及肥胖相关基因的变异，还有个体的代谢类型、食欲消化吸收功能、睡眠质量和代谢的效率，它是单纯性肥胖的一个发病基础，而不良的生活习惯，比如体力活动过少，还有能量摄入过多，它是发病的一个必要条件。

在流行病学调查表明，多数的单纯性肥胖者都有家族的发病倾向，肥胖的父母所生的子女中，患单纯性肥胖者，比父母双方体重正常者所生的子女，会高5-8倍，但是多数的单纯性肥胖并非肥胖基因，或者是肥胖的相关的基因突变所致。