肠镜检查毕竟是个有创的操作，在做检查之前，医生常规都会给患者谈到肠镜检查的大致的风险，主要的风险主要包括出血，最主要的原因是有时候做活检或者是在操作过程过于粗暴，可能引起肠道损伤出血、穿孔，这是肠镜检查中最为严重的并发症，但是现在随着肠镜检查技术的改善，上述的这些风险都得到有效的控制。 小肠镜的操作难度较大，一般是应用于小肠疾病的诊断，目前来说在平常应用的还是比较少。现在有胶囊内镜，但是胶囊内镜的最大不足是不能解决活检以及治疗的问题，从目前来说，它还是不可能代替普通的胃肠镜。而且胶囊内镜在检查过程中发现的问题，到时候还是得要做胃肠镜来进一步明确诊断。因此，从目前来说胶囊内镜以后的技术发展可能解决这些问题，但是目前胃肠镜的检查还是更多的广大消化患者首选的诊治方案。

一般来说，如果是做无痛肠镜检查法，因为麻醉药物应用后患者就睡着了，在整个检查过程中患者是没有任何不适的感觉。但如果是做普通的肠镜检查，患者可能会出现以下这些情况。 首先是患者的肛门处因为镜子反复摩擦，可能会出现坠胀感，个别会出现疼痛。在做检查的过程中，为了更好地暴露视野，方便操作，肠镜检查时医生会向肠腔内注气，让肠腔充分扩张，因此就会出现腹部饱胀不适的感觉。在过肠道弯曲的时候，由于镜子的牵拉，患者可能会出现腹痛，但总体而言如果按照医生的要求去做，这些不适的感觉会降到最低，一般人都可以耐受肠镜检查的。

肠镜检查时患者一般需要左侧卧位，露出臀部，如果需要做无痛肠镜检查者，术前需要做静脉麻醉，做好吸氧、心电监护的准备。医生通过肛门指检检查肛门，做好润滑准备，然后再进镜。做普通肠镜的患者，在做检查的时候应该要深呼吸，放松，配合医生，这样在做的过程中可以减轻患者的不适。在进镜的时候，尤其是在过弯的时候，患者可能会有些疼痛感，尤其是术后出现腹腔粘连，或者结肠弯曲过多的人，对疼痛敏感的人，可能会出现疼痛明显。这时候患者做检测的时候一定要放松，配合医生。 在检查过程中，医生可能会根据需求，要求患者翻身、改变体位等，其目的就是为了减轻患者的痛苦，因此做普通检查的患者一定要配合医生。做检查一般是先进镜，镜子到达了回肠末端以后，一般来说普通的肠镜最能达到的位置也到了，到了这个部位以后医生就开始退镜观察，依次观察回盲部、升结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠以及直肠。根据发现的病变，有时还可能做活检，甚至如果有些病人条件许可，也可以在镜子下直接做一些治疗。做普通肠镜检查一般耗时10-30分钟左右，无痛肠镜检查一般需要30分钟左右的时间。