吞咽障碍的危害一般有三种：

第一种就是误吸，是吞咽障碍最常见并且需要优先处理的一种并发症。通常食物残渣、口腔分泌物等误吸支气管还有肺，会引起反反复复的肺部感染，甚至出现窒息，危及生命。

第二个危害就是营养不良，因为进食困难，机体所需的营养或者液体得不到满足，出现水电解质混乱、消瘦、体重下降，因而可以引起生长发育的障碍，甚至因营养不良导致死亡。营养不良可以增加患者各种感染的发生率和病死率，是导致不良结局的一个重要的原因。

第三个危害是心理与社会交往的障碍，因为不能够经口进食，佩戴着鼻饲管，可能患者就会容易产生抑郁、社交隔离等精神心理症状，对于儿童来说，甚至有可能会出现语言交流技巧障碍、发育迟滞等表现。