肠结核的临床症状主要包括两大部分，第一部分是结核菌感染引起的全身中毒症状，包括有低热、盗汗、纳差、乏力、贫血等等。如果合并有肺结核的话，还可能有咳嗽、咳痰、咯血等呼吸道的症状。另一部分就是肠道局部引起的症状，它可能有腹痛、腹泻、便秘，腹泻便秘交替，引起梗阻时还有肠梗阻的肛门停止排便、排气，恶心、呕吐等消化道的症状。