根尖肉芽肿与根尖囊肿是慢性根尖周炎的不同病理表现，两者的鉴别主要是在X线片上，根尖肉芽肿的根尖见圆形的低密度透射区，边界较清晰，一般约一厘米左右，周围的骨质可以正常。根尖囊肿的根尖透射区较大，边界清楚，多数有一圈致密的骨白线包饶。在临床上，根尖肉芽肿可以有部分活髓，遇冷热酸甜等刺激，会有疼痛感。患有根尖囊肿的牙齿往往是死髓牙，无自觉症状，偶有叩痛。