随着内镜诊疗经验的积累及内镜手术器械的不断开发，内镜下可治疗的疾病越来越多，原来需要外科手术治疗的一些疾病，可以实现内镜下微创治疗。内镜治疗具有微创、疗效确切，可重复、费用低等优点。

目前开展的内镜下治疗主要有内镜下止血术，消化道良性肿瘤及早期恶性肿瘤切除术，消化道狭窄扩张和支架治疗，消化道异物取出，ERCP（经内镜逆行性胰胆管造影） 治疗，胃镜下胃造瘘及空肠造瘘，对于贲门失迟缓的病人，可经口内镜肌切开，也就我们常说的POEM等。