单纯性肾囊肿通常无症状，大部分在行腹部的影像学检查比如B超、CT时发现。

但当囊肿压迫引起血管闭塞或尿路梗阻时，也可出现血尿、腰痛、感染、肾盂积水、高血压等表现。当囊肿逐渐增大，出现肾脏包膜牵扯，有时也可以出现腰部的隐痛不适，囊内有出血，可以出现血尿，甚至肉眼血尿。

当单纯性肾囊肿的超声表现为单个或多个圆形或类圆形低回声区，囊壁光滑、无间隔以及囊内无碎片。囊腔内若超声显示不清，可以行CT检查帮助诊断可有助于诊断。