灼口综合征由于病因尚不明确，目前仍缺乏特异的治疗方法。治疗主张全身、局部，中医和西医，生理和心理相结合。 其对症的治疗有：消除局部刺激因素，疼痛明显者可局部应用止痛的药物。

另外一方面可以采取全身治疗，治疗全身系统性疾病，如糖尿病、贫血、维生素缺乏等。失眠、抑郁明显者可用谷维素、维生素B等药物，抗抑郁药物也可对该病的治疗有一定帮助。

或采取认知疗法等心理治疗。中药治疗以疏肝解郁为基本治疗方法，成药则可选用加味逍遥丸、坤宝丸等。

其他的治疗，如非药物治疗方法，可以单独使用或作为药物治疗的辅助疗法，包括压力管理、瑜伽、运动、与心理治疗等。