新型冠状病毒感染性肺炎的诊断，依赖于流行病学史、临床表现及实验室检查，病毒核酸检测是目前病毒学诊断的主要方法。阳性结果是确诊的依据，需要在P2级实验室内进行，操作者需要实行三级防护，对于符合新型冠状病毒感染性肺炎的临床疑似病例，如果取痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物、血、尿及肛拭子等标本，检测到新型冠状病毒核酸阳性或者病毒基因测序与已知的新型冠状病毒高度同源，可以确诊新型冠状病毒感染性肺炎。