颈脊髓损伤时，由于呼吸肌和呼吸辅助肌肉受损，这个时候患者咳嗽力量减弱，不能有效地咳出痰液。同时颈脊髓损伤的时候，通常伴有交感神经功能障碍，副交感神经功能活跃，这个时候会导致气道分泌物的增加。

因此，颈脊髓损伤后，肺部感染主要的治疗措施就是有效的引流痰液，可以通过气管插管或气管切开管吸引痰液，可以通过翻身拍背、辅助咳痰等方式辅助痰液的排出。

同时要根据患者肺部感染的致病微生物给予相应的抗微生物的药物治疗。

同时要加强患者的营养，提高免疫力，使患者抵抗微生物感染的能力提高，也可以有效的减低肺部感染的发生。