窦性心律不齐本身并没有危害。

在临床上大部分存在窦性心律不齐的人为生理性的窦性心律不齐，以年轻人最为多见，往往跟呼吸周期明显相关，由于在吸气时心率增快呼气时心率减慢，从而会导致心律不齐的发生，随着年龄的增长，这种窦性心律不齐会逐渐消失。

当然有些人如果存在器质性的心脏病，在心脏病的基础上出现窦性心律不齐，这时候主要是基础心脏病对人体会造成危害，需要对基础心脏病进行积极的治疗，使病情长期保持稳定。