感染性心内膜炎的死亡率是比较高的，研究表明感染性心内膜炎的院内死亡率高达15%-30%，其预后跟患者身体的基础状况，是否存在严重的并发症以及心脏超声是否存在严重的病变，如瓣膜穿孔和腱索断裂等都有明显的关系。

患者常见的死亡原因是严重的心力衰竭、急性肾功能衰竭、发生重要器官的栓塞以及细菌性动脉瘤破裂等。因此对于感染性心内膜炎需要积极的进行预防，一旦发生要早发现，积极的给予敏感的抗生素进行治疗。