引起儿童孤独症的病因虽然在目前还不是很明确，但是我们现在的研究多集中在像遗传基因、神经发育、神经生化，还是一些免疫和一些病毒感染的因素，现在我们也越来越多的证据表明我们的生物学因素，其中最主要的就是一个遗传因素，在我们孤独症的发病中起着非常重要的作用。另外的话，像我们胎儿期的一些病毒感染，像先天性风疹病毒、巨细胞病毒感染，这些现在也是被认为和孤独症的发病是有关系的。还有像一些免疫系统的一些异常，也会有影响，像围产期的感染，一些其它的致病因子也是有重要的关系。