慢性结肠炎在广义上是一种慢性、反复性、多发性，因各种致病因导致的肠黏膜的大片水肿、充血、糜烂和溃疡，肠镜下一般是可以确诊的。狭义上的溃结，主要是侵及直肠和结肠的黏膜层和黏膜下层。最常见的早期症状为血性腹泻，多为脓血便、水样便、黏液便、稀便多种形式可见，轻者大便每日2-3次，重者可达10-30次，病变越靠近肛门，便意越急，次数越多，里急后重明显。

其次的话，是表现为腹痛，轻者隐痛，典型者为绞痛，有腹痛、便意、便后缓解的规律，轻者下腹轻度压痛，重症或者是暴发型者食欲减退、上腹饱胀不适、恶心、呕吐；伴有关节痛、皮肤结节性红斑、口腔溃疡、眼结膜炎、角膜炎等肠外表现。上述的症状往往在肠道症状前出现，诊断较困难。同时慢性结肠炎可能发生肠息肉、狭窄、梗阻等并发症，严重的并发症有中毒性巨结肠、肠穿孔、下消化道出血，常发生于本病的活动期，一旦发生了并发症，常需手术治疗。