肠绞痛和消化不良的主要区别在于，肠绞痛有可能是肠道的器质性病变导致的腹痛，患者疼痛难忍，以脐周为主。导致肠绞痛的原因有可能是功能性的疾病，也有可能是器质性疾病引起来的。功能性疾病，比如患者餐后剧烈运动、暴饮暴食，以及腹部受凉都可能会出现肠绞痛。

如果患者存在有克罗恩病、结肠恶性肿瘤、肠结核、肠伤寒等等也可能会导致肠绞痛。消化不良的患者可能主要会出现有腹胀、嗳气、腹泻与便秘等等情况，极少数才会出现有肠绞痛的发生。