电子结肠镜检查时患者会出现腹部轻度的疼痛以及不适，但是一般可以忍受，主要是由于当结肠镜头进入肠腔以内以后，经过肝区和脾区时，镜头会有弯曲，所以患者会出现憋胀疼痛不适，一般在检查前会在镜头局部涂抹止疼类的凝胶来缓解患者由于局部出现的疼痛不适感，如果患者疼痛剧烈，可以让医生动作轻微，避免出现局部的肠道穿孔，不建议肠镜检查前进行局部，或者是麻醉后检查，避免由于患者痛觉消失而导致出现穿孔。