克罗恩病与肠易激综合征的主要的区别在于克罗恩病使器质性疾病，也叫做阶段性肠炎，肠易激综合征是一种功能性疾病。

克罗恩病的主要症状包括黏液样便、脓血样便，患者还会出现畏寒、发热，并发症中可能会出现瘘管的形成，导致患者出现腹膜炎。

肠易激综合征是一种功能性的疾病，主要的症状是腹痛、腹泻、便秘等，肠易激综合征的患者治疗上，主要是使用一些调节肠道菌群的药物，以及调节肠道神经的药物进行治疗。