如果患者确诊为肛瘘，不能不治疗，如果长期不积极对症治疗肛瘘，非常容易导致肛瘘瘘管增粗或者是分支增多，甚至长期反复炎症刺激以后，某些瘘管还容易发生癌变，所以肛瘘患者确诊以后，建议尽快进行对症治疗。

肛瘘的治疗方法，主要是以手术为主，肛瘘手术方式主要采用肛瘘切开挂线手术，将局部瘘管壁进行去除，同时保存和保留患者括约肌的功能良好。肛瘘手术之后，患者需要清淡饮食，避免局部分泌物增多，而导致炎症刺激，甚至出现局部肛瘘的复发。