肛瘘发生以后需要尽早进行手术治疗，如果长期反复发作的肛瘘，不积极进行手术治疗，有可能导致肛瘘的瘘管壁增粗，从而导致局部的炎症以及脓血会增多，并且肛瘘反复发作以后，还有可能引起瘘管的分支增多，瘘管分支增多有可能蔓延至肛门直肠间隙，或者延伸到更深的解剖组织结构内，从而加重了之后的治疗难度，还会导致盆腔感染。所以肛瘘需要尽早进行手术治疗，并且有资料显示，肛瘘还有一定的癌变几率，发生肛瘘以后，需要尽早进行肛瘘切开挂线手术。