肛瘘和肛周脓肿是一个疾病发生的两个不同阶段，因为肛瘘和肛周脓肿都属于肛周局部肛隐窝处感染性的疾病，其发病原理是相似的，但是临床表现不一样，肛周脓肿的临床表现主要是肛门局部皮肤和组织的红肿热痛，以及脓腔和脓液形成为主，患者疼痛比较剧烈，

而当肛周脓肿破溃以后会形成肛瘘，属于局部感染性疾病的第二个阶段，肛瘘患者一般并不会有特别剧烈的疼痛，相反会出现肛门局部外口间断性的流脓，或者是瘙痒刺痛，但是肛瘘和肛周脓肿发生以后都需要尽快进行手术治疗，避免病情加重或者感染加重。