肛瘘手术主要是肛瘘切开挂线术，其手术难度和手术是否出现疼痛，主要是根据手术的严重程度而定，当然也和肛瘘的手术麻醉方式有关。

如果是局部麻醉，术后六小时以后可能会出现局部的疼痛，尤其是当肛瘘位置较深，出现复杂性肛瘘的患者，由于局部创面较大，所以疼痛比较剧烈。

如果手术的麻醉方式为半身麻醉，术中配合使用亚甲蓝注射神经阻滞术，术后疼痛时间会稍微减轻，一般来说12小时以后才可能出现局部的疼痛，如果疼痛剧烈，可以让患者口服或者外用止疼药物进行治疗。