肛瘘和痔疮是两种不同类型的肛肠科常见疾病，并不能说哪一个疾病比较严重，只能是根据每一个疾病的发展情况和发展程度，来定其严重程度。

如果是单纯的表浅性肛瘘，一般疾病严重程度较轻，主要是以手术为主，而如果出现了高位复杂性肛瘘，那么除了手术以外，还需要进行完善性的盆腔核磁检查，来排除是否存在深部扩约肌和坐骨直肠间隙的感染。

而痔疮的疾病严重程度主要是以环状混合痔，或者伴随有嵌顿为主，如果出现了环状混合痔嵌顿，建议尽快进行手术治疗，避免坏死，如果痔疮出现长期大量的便血时，也需要尽早进行手术，避免患者出现贫血。