补体C3偏低的原因比较多，比较常见的是自身免疫性疾病，也可以见于部分感染性疾病和血液系统疾病，比如系统性红斑狼疮的急性发作期，可以出现补体C3偏低，另外肾病综合征也可以出现补体的降低。

补体C3偏低并没有特异性，这个还要根据患者的临床表现，和其他的辅助检查结果来综合判断，另外补气偏低，受很多因素的影响，比如，抽血之后血液放置的时间，外界环境的变化，季节的变化都会有相应的影响，所以不能单独依靠补体C3偏低就诊断某种疾病，还要看患者的临床表现，比如如果患者有明显的面部皮疹、关节痛、口腔溃疡的话，就高度怀疑系统性红斑狼疮。