牙周脓肿通常是不会自愈的。

牙周脓肿，一般是由于患者存在较深的牙周袋，而牙周袋中会存在很多的细菌，所以感染之后导致患者发生牙周脓肿，牙周脓肿发生之后，想要痊愈，需要进行人为干预，自愈的可能性是非常小的。

建议患者可以到正规医院的口腔科将牙周袋切开，然后进行排脓引流，脓液被排出后，可以使用生理盐水和双氧水交替清洗牙周袋，将食物残渣以及细菌完全清除干净，同时可以配合口服以及局部使用一些消炎药物来进行治疗。