上呼吸道感染的病原体有很多大部分是以病毒感染为主，比如鼻病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒、冠状病毒，这些病毒都可以侵犯人体的上呼吸道黏膜导致黏膜出现充血水肿，炎性分泌物渗出增多，从而导致患者出现一系列的临床症状，比如发热、咳嗽、咳痰、打喷嚏、流鼻涕、咽干咽痒、头痛、头晕等等。

但是也有极少部分上呼吸道感染的病原体是以细菌为主，例如溶血性链球菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌。如果是细菌感染导致的，需要予以抗感染治疗，如果是病毒感染所引起，需要予以抗病毒治疗。