轻微咳嗽是否能打流感疫苗，要视具体的病因和病情来定。

如果患者仅因为咽喉部的干痒诱发其咳嗽、无明显其他不适，此时是可以打流感疫苗。对于慢性呼吸系统疾病在其稳定期的时候偶有轻微的咳嗽，例如慢支、慢阻肺稳定期的时候是可以打流感疫苗。

但如果患者正处于疾病的急性期或慢性疾病不稳定期、急性加重等情况时有轻微的咳嗽，此时是不能打流感疫苗，例如急性支气管炎、感冒发热的患者，此时是不能打流感疫苗。故当发生轻微咳嗽时要具体分析是何种原因引起的咳嗽，并视病情来决定是否能打流感疫苗。