乳腺增生一般认为和内分泌紊乱有直接的关系，乳腺增生主要的组织学变化就是乳腺本质的增生过度和复旧不全，这种现象是由于雌，孕激素比例失衡的结果。

性激素引起本病的生理机制，主要表现在性激素对乳腺发育及病理变化均起主导作用，雌性激素促进乳管及管周纤维组织增生，孕酮促进乳腺小叶及腺泡的发育，正常乳腺组织结构随着月经周期激素水平变化，而发生着生理性与增生复旧这种周期性的变化。

如果雌性激素水平正常或者过高，而孕酮分泌的过少，或者两者之间不平衡，便引起了乳腺的复旧不全，组织结构发生紊乱，引起乳腺增生。