溃疡性结肠炎和克罗恩病侵及范围是不一样的，溃疡性结肠炎主要是一个倒灌性的，从直肠开始向结肠病变发展，病变局限在直肠、结肠；克罗恩病的发病部位主要是从口腔到肛门的全程的消化道跳跃式发展，就是每个部位都可能发病。

溃疡性结肠炎发病是在黏膜层、黏膜下层，很少侵及到肌层，而克罗恩病是一个透壁性的改变，往往穿透肌层，克罗恩病更容易出现瘘管、穿孔这种表现。

在临床表现上，溃疡性结肠炎会出现黏液脓血便，但是克罗恩病黏液脓血便非常少见。溃疡结肠炎从直肠到结肠弥漫性的充血水肿，浅的溃疡、颗粒样改变，质地比较脆，而克罗恩病会出现纵深的溃疡，看上去像鹅卵石样的改变。

病理改变主要是溃疡性结肠炎会出现黏膜层的炎性的浸润，包括隐窝脓肿的表现，克罗恩病会出现非干酪样肉芽肿的改变，主要是一些淋巴细胞慢性炎症的浸润。