肾盂肾炎是泌尿系感染的一种，多数是由大肠杆菌引起的，所以往往也是针对大肠杆菌，应用各种抗细菌药物来治疗。

抗细菌药物的治疗有很多选择，一类就是喹诺酮类药物，比如说环丙沙星、诺氟沙星等；再有一类就是头孢类药物，比如二代、三代头孢，现在对于大肠杆菌的抗菌活性都比较好；还有一些大环内酯类药物。

其它就是给药途径，可以口服给药，对于全身症状明显，口服给药效果不好的病人，也可以考虑给予静脉输液治疗。