南昌大学第二附属医院普通外科建科于1927年，是伴随着南昌大学第二附属医院的前身——江西省省立外科医院诞生而诞生，是江西省最早开展外科学临床诊治及研究的专门医疗机构，是我省外科学的发源地，几乎我省所有新兴外科专业均由我科分出。我省第一台阑尾切除、胆囊切除、胃大部切除、门体分流、肝切除、胰十二指肠切除…原位肝移植、背驼式肝移植、再次肝移植、腹腔镜肝脏切除、解剖性肝（段）切除、经自然腔道内镜外科手术（NOTES）等均由我科完成。国内著名外科专家高茂山、杨仲达、胡献尚、黎学浚、李建业、林尊伟、余安国、陈安球、刘勇、盛茂鑫、谢敏、蒋筱强、傅华群、熊吉信等曾先后担任科室学科带头人。科室在建立后为江西省外科的普及、发展、提高作出了同道公认的杰出贡献。

南大二附院普外科现任学科带头人为邵江华教授。目前，学科是江西省省级临床重点专科；江西省“十五”，“十一五”，“十二五”重点学科、高水平学科；其中肝胆外科、血管外科、甲状腺外科为江西省医学领先学科；江西省卫生厅领先学科省市共建项目援建单位；江西省医学学科省县共建项目援建单位。同时，江西省唯一的国家卫计委首批外周血管介入诊疗培训基地、江西省普通外科临床医学研究中心、江西省普通外科质量控制中心、江西省腹腔镜（普通外科）质量控制中心暨腹腔镜培训基地，江西省肝胆疾病工程技术研究中心、江西省肝胆外科疾病诊疗中心、南昌大学肝胆外科研究所均挂靠我科。

学科现分五个科室，十个病区，分别为肝胆胰外科、胃肠外科、血管外科、甲状腺外科和乳腺外科，共有开放床位478张。2018年，我科门诊人次10万余人，住院人次达一万八千余人次，年手术量一万三千余台。

科室拥有国内先进的医疗仪器和设备，能够完全满足普通外科临床诊治的硬件需求：拥有德国ERBE电外科VIO系统、美国史赛克腹腔镜工作平台、射频消融肿瘤治疗系统、经肛门内镜纤维手术系统、Force Triad高频电外科手术系统（能量平台）、美国强生超声刀、Olympus电子胆道镜、美国GE超声仪、美国狮王手术摄像系统、日本Takasago腹部牵开系统、多功能微波手术器、心电监护系统、德国STORZ甲状腺镜、乳腺磁共振、乳房数字钼靶摄片、全进口高档彩超、美国麦默通乳房活检系统（Mammtome）、CT、核素扫描及前哨淋巴结检测系统、数字大C臂血管影像系统、周围血管检测工作站、静脉曲张激光治疗系统、多排螺旋CT、磁共振成像系统、其他还有血管内超声、主动脉内球囊反搏系统等多种先进诊疗设备，为普通外科疾病的临床诊治和科研提供了坚实基础。