神经内科是医院重点建设专科，成立于1980年，神经内科分设神经内一科、内二科、总院神经内一科、总院神经内二科四个病区。现有医护人员51人，其中主任医师2人，副主任医师4人，硕士研究生3人，编制床位151张。

科室拥有肌电图、诱发电位、脑电地形图、24小时动态脑电图、TCD、血液流变学检测仪、惠普心电监护仪等先进设备。

科室对脑血管疾病、中枢神经系统感染、癫痫、中枢神经系统、脱髓鞘疾病、椎体外系疾病、睡眠障碍、认知功能疾病等疾病诊疗方面积累了丰富的经验，并达到省内先进水平，其中脑出血微创清除术达到了省内领先水平。近3年来，神经内二科广泛开展脑血管造影术、颈动脉支架置入术及颅内动脉瘤栓塞术，能独立完成椎动脉支架置入术。此手术的成功开展为九江市各级医院首例标志着我院神经内科血管介入治疗达到省内水平。

科室始终坚持“以人为本，以健康为中心”的服务理念，近年来，在国家、省、市级专业刊物发表论文近30篇，《脑出血微创清除术》获市科技进步二等奖并获卫生部医学科技中心先进单位，1项课题获全军科技进步一等奖，1项课题获得南京科技进步四等奖，科室获国家级“青年文明号”称号。