小孩子突然发烧39℃，常见的原因如下：

一，急性上呼吸道感染，由于病毒感染所形成的突发高热，一般会出现反复持续高热的一个状态。

二，急性胃肠炎，如因进食不当或因进食不干净的食物引起急性胃肠道炎症时，也会出现突然之间高烧的一种情况，同时有可能会伴有恶心、呕吐等其他的伴随症状。

三，突然发烧39℃，如果因受凉等一些因素时，也会出现发烧的情况，或者因淋雨或者是其他一些感染因素，形成急性扁桃体炎或者是急性肺炎等情况时，也有可能会出现突然发烧的情况。当然同时也有可能会伴有其他的伴随症状，比如急性喉炎引起，除了高热之外，会伴有突发声音嘶哑、犬吠样咳嗽等其他的伴随症状。