大多数情况下H1N1流感是没有后遗症的，H1N1流感属于甲型流感，甲型流感这种疾病多数情况下通过积极的抗病毒治疗以及对症治疗，病人的病情是能够完全控制的，通常来讲不遗留有后遗症。

但是需要注意，H1N1流感有的时候也能够合并有肺炎等并发症，有的时候严重的病毒性肺炎可以导致肺纤维化，这些病人在治愈以后是有可能会遗留有一些肺部后遗症的，可能会遗留有肺部间质性的改变等相关的情况。所以对于H1N1流感的患者，主张尽早的应用神经氨酸酶抑制剂来控制患者的病情，来减少H1N1流感出现后遗症的机会。