百日咳潜伏期一般没有任何自主不舒服的症状，如果有和患者的密切接触，体内没有抗体，怀疑体内有这种致病菌的话，可以进行相应的辅助检查进行确诊的。 可以进行细菌学的检查、荧光抗体法，用鼻咽拭子分泌物涂片，或者是鼻腔黏膜压片荧光抗体染色检测特异的抗原，在早期的阳性率可达75%-85%。也可以进行血清方面的补体结合试验方法，检测特异的抗体，可以有效的对不典型的病例进行辅助诊断。