多囊肾结石的患者，随着病情进一步发展以后，会成为尿毒症，因为多囊肾本身就是一种遗传性的肾脏疾病，是导致尿毒症的原因之一。随着时间延长，肾脏的囊肿体积会逐渐增大，数目也会逐渐增多，这个时候增大的囊肿就会压迫肾脏实质，引起肾脏结构和功能出现异常。

再加上有结石存在的话，就容易导致梗阻性肾病，也容易导致肾盂肾炎的发生。这些都是促进肾脏功能进展的一些恶化的因素，所以针对多囊肾结石的患者，在病情稳定的情况下可以使用排石的药物或者碎石治疗，只有这样才能够延缓肾脏病的进展。