急性肾盂肾炎、无功能肾在治疗方面一定要针对患者病因进行治疗，由于导致急性肾盂肾炎发作的主要原因是与细菌感染有关系，尤其是革兰氏阴性杆菌，所以在治疗方面一定要选择敏感的抗生素进行治疗，而且所选择的抗生素一定是对肾脏和身体其他器官没有损伤的作用。

一般如果在没有过敏因素的情况下，建议患者使用青霉素类药物，或者使用头孢类的抗生素，这些药物一方面是广谱的抗生素，另外一方面副作用都是比较小。而且在治疗的过程中一定要监测肾功能的变化，同时还要定期进行尿常规中段尿细菌培养的检查，除此之外还要多饮水等等。