肛瘘发作会导致患者出现肛旁肿痛以及流脓血水。对于肛瘘发作可以先药物保守处理，比如在排便之后选择肛门洗剂或者是高锰酸钾溶液等药物进行坐浴，坐浴时间控制在五到十分钟，可以起到消肿止痛的作用。坐浴完后可以选择金黄膏或者是莫匹罗星软膏进行局部涂抹，也可以起到消肿、消炎的作用。同时对于感染严重的可以选择静滴抗生素或者是口服抗生素等药物进行消炎。但是在临床上对于肛瘘的治疗是建议尽早的采取肛瘘切除术处理，尽早的清除内口以及瘘管，才能彻底治愈肛瘘。如果肛瘘反复发作，很容易导致肛瘘支管越来越多，形成复杂性肛瘘，导致后期手术难度增加，术后创面增加。