婴儿发烧过后起红疹的病因通常有以下几种，首先，如果是发烧3-5天之后热退起的红疹，一般考虑为婴儿急疹，为人类肠道病毒6型感染引起。其次，如果发烧3-4天后起红疹之后又反复发高烧，那么通常要注意排除麻疹。第三种情况，发烧过后起红疹，还需要注意考虑是否由过敏引起，包括对病原体本身，或者药物过敏的可能性。最后一种情况，就要注意发烧过后起红疹，即便是病毒感染，如果发烧时间久，也可以继发新的细菌感染，出现皮疹的情况。