肛周脓肿的住院时间主要跟肛周脓肿的复杂程度息息相关，肛周脓肿越复杂，住院的时间也就越长。由于肛周脓肿属于化脓性的疾病，手术创面不能缝合，手术创面需要用肉芽自然生长逐渐填充，所以住院时间可能跟个人的恢复能力还息息相关。一般的肛周脓肿一般在术后至少两到三周内才能长好，住院时间也一般在两到三周。