肛瘘发病率国内跟国外都不一样，美国布鲁克林医院对美国的肛瘘发生率作了一个统计，他们的统计的发病率是0.69%，而在我国肛瘘占肛肠发病人数的1.67%-3.6%，其发病高峰常常是20-40岁的青壮年， 一般男性多于女性，男女之比一般为5~6:1，也就是说五六个男性的肛瘘才会有一个女性的肛瘘。