脑脓肿和脑囊肿的区别是很大的，脑脓肿顾名思义里面是脓液，既然是脓液，就肯定是化脓性细菌感染所引起的，脑脓肿大部分继发于急性化脓性脑膜炎、爆发性脑炎，或者是慢性中耳炎反复感染所引起的。对于这样的患者首先要抗感染治疗，炎症控制以后可以考虑进行微创手术治疗。而脑囊肿包括蛛网膜囊肿和表皮样囊肿，蛛网膜囊肿是一种先天性的残留，而表皮样囊肿是一种低度恶性的肿瘤。