女性经常口腔溃疡，目前没有明确的病因，但认可度比较高的病因是遗传、免疫、环境三联因素，例如家族中有人容易出现口腔溃疡，遗传的因素比较大，加上自身的免疫力下降，还有一些环境因素的改变，都容易引起口腔溃疡的经常发作。

还可能与一些全身疾病有关，比如反复口腔溃疡的人会出现胃溃疡、肠粘膜溃疡或者是溃疡性结肠炎，也有的人认为女性经常口腔溃疡与内分泌功能的紊乱有关，比如女性经常在月经期前后会出现口腔溃疡，对于内分泌的系统、雌激素和孕激素的增加或减少有关，另外口腔溃疡的发生还与血液黏稠度也有关系。