龟头炎区分真菌还是细菌感染龟头，主要根据患者的临床表现来区别，一般真菌感染引起的龟头炎表现为包皮和龟头有红斑，而且还可出现小疱疹，红斑的边缘比较清楚。急性发作的时候会有糜烂、渗出，而且患者的冠状沟处有白色奶酪样斑片。

细菌感染引起的龟头炎主要表现为龟头局部潮红，阴茎的皮肤发红肿胀，自觉龟头有灼热和瘙痒的感觉。翻开包皮可见包皮内面以及龟头充血、糜烂，甚至有渗出和出血。如果感染严重，还可见到小溃疡，并且有乳白色脓性分泌物。