导致甲状腺结节出现疼痛症状的原因有很多，而最常见的是亚急性和急性甲状腺炎以及恶性肿瘤等疾病。

亚急性和急性甲状腺炎多数是由于感冒、咽炎、腮腺炎等疾病，病毒或细菌的感染最常见。感染的急性期会出现颈部甲状腺不同程度的肿大伴随疼痛感。另外，恶性肿瘤因为瘤体持续的增大，甲状腺组织受破坏而压迫周边器官，也可能引起甲状腺区域的疼痛肿胀感。甲状腺的刺痛还可见于结节性的甲状腺肿、甲状腺囊性结节等等，必要时可行甲状腺细针穿刺，以进一步的明确诊断。