金黄色葡萄球菌肺炎可能会导致一些全身的并发症。比如可能会引起呼吸衰竭，甚至呼吸窘迫综合征，也有可能会并发休克等相关的情况。出现了这些情况，可以诊断为脓毒症，多脏器功能衰竭，这种情况提示患者的病情很危重的，死亡率是很高的。

金黄色葡萄球菌肺炎相对来说还容易合并有胸腔积液，甚至合并有脓气胸这种情况，出现这些并发症可能需要给予胸腔置管引流的治疗。金黄色葡萄球菌肺炎还可能会合并有肺脓肿，甚至可能会合并有血源性的肺脓肿，出现这种情况病人的病情也是很重的，治疗的时间也是比较长的。