婴儿痉挛症多数的预后是不好的，主要会出现智力运动的发育落后，惊厥难以控制或者可以转化为其他的发作类型。有约半数的患儿可能会从痉挛转变为全身性的发作，或者是失神的发作，或者是强直阵挛的发作等，出现各种新的发作形式。

部分的婴儿痉挛还可以发展成为其他的综合征的表现，大多数的患儿会遗留严重的精神运动发育落后的表现，语言的落后，运动的落后，只有极少数比例的婴儿痉挛早期是可以通过治疗，达到发作完全缓解，也不遗留后遗症的情况。

这一类预后良好的婴儿痉挛，主要它会没有一些原发的基础疾病，比如说没有结构的异常，也没有遗传学的病因，而且它的早期对药物的反应也是比较好的，这一小部分的婴儿痉挛，它的预后相对比较好。