引起后脑勺疼的主要原因有：

第一、后枕部神经的原因。

第二、颅内后脑部的原因，有后脑部颅内出血、梗塞，譬如小脑梗塞、脑膜炎等。

第三、最常见的还是后脑勺一些神经问题，引起这些神经损伤最主要的原因是上颈段的问题，上颈段发出一些神经支配了后枕部，这些神经受到压迫，或是受到一些外界因素的刺激，如着凉、发炎等。

最常见后枕部的疼痛是枕神经痛，除了后枕部以外，可能还涉及到耳后等部位，造成这些原因主要是长期的伏案工作、后颈部肌肉紧张等。