理论上卵巢囊肿应该是不影响怀孕的，但前提是卵巢囊肿是不是双侧都有。因为正常的女性有左侧卵巢和右侧卵巢，两个月间断的不停的排卵，如果只是左卵巢长了囊肿，右卵巢也是可以正常排卵的，所以不会造成不孕。

但是有一种卵巢囊肿可能会影响怀孕，就是卵巢的巧克力囊肿，称之为子宫内膜异位症。这种囊肿可能会造成一些盆腔粘连，导致输卵管活动不好，影响怀孕。

如果发现卵巢囊肿，确实自然试孕，在排卵期的时候试孕有三到六月以上还是一直没有怀孕，建议可以考虑到妇科进行进一步的治疗，检查卵巢囊肿是否跟怀孕有关。