强直性脊柱炎是自身免疫性疾病，病因尚不明确，但是90%强直性脊柱炎患者是有遗传因素的，并且强直性脊柱炎的发病与一种人体白细胞抗原有直接关系，由于这种人体白细胞抗原是由遗传决定的，因此遗传是强直性脊柱炎发病的重要原因之一。

但是强直性脊柱炎还有其他致病因素，比如内分泌失调、代谢障碍，感染等等，患者自身及周围环境等都会对本病发病产生影响，像泌尿生殖系感染，胃肠道、肺部感染就极有可能导致强直性脊柱炎的发生，患者年龄、体质、营养状况，天气潮湿和寒冷等环境因素均可对本病产生影响。